Um ein UEFI-Setup vom USB-Stick zu starten,muss dieser mit  FAT32 formatiert sein. Ein Problem von FAT32 ist, dass die Größe einer einzelnen Datei  mit 4 GB begrenzt ist.
Möchte man z.B. Windows Server 2012 R2 verwenden, dann ist die WIM Datei über 5 GB groß.

Hier muss man nun ein wenig in die Trickkiste greifen. Aber das Problem lässt sich mit Windows eigenen Boardmitteln elegant lösen.

Mein Lösungsweg sieht folgendermaßen aus:

1. Windows Server 2012 R2 ISO mounten und Inhalt in einen Ordner kopieren.
2. Nun muss man die >5GB große install.wim Datei aufsplitten. Dies erreicht man mit folgendem Befehl:
   Dism /Split-Image /ImageFile:D:\install.wim /SWMFile:D:\install.swm /FileSize:4000 /CheckIntegrity
   Je nach eingestellter FileSize erhält man nun mehrere install.swm Dateien; die install.wim Datei kann gelöscht werden.
3. Nun kann man entweder wieder eine ISO Datei erstellen oder man kopiert den Inhalt auf einen bereits für UEFI formatierten USB Stick.

Für das Erstellen des USB Sticks habe ich das Programm Rufus verwendet

weitere interessante Seiten zu diesem Thema:

https://www.thomas-krenn.com/de/wiki/Windows_UEFI_Boot-Stick_unter_Windows_erstellen

http://www.win-lite.de/forum/windows-8/how-to-uefi-usb-bootstick-mit-wims-4gb/